Projekty hledající potenciální léky proti COVID-2019 ve Folding@home
Tyto distribuované výpočty nebudou mít formu úplně nového programu, zastřešuje je totiž projekt folding@home, který už mnozí z vás budou znát či přímo provozovat. Jde o distribuované výpočty, kdy si domácí počítače rozdělují práci na simulaci chování složitých molekul, kteréžto poznání pomáhá s vývojem léčby různých lidských nemocí, od rakoviny po Parkinsonovu nebo Alzheimerovu chorobu (takže pomůžete dobré věci, i pokud zůstanete zapojení po skončení současné pandemie).
Do Foldingu@home bylo nyní zařazeno několik výzkumných projektů, které se viru COVID-19 týkají: analyzují jeho strukturu a interakci s lidskými buňkami a hledají látky, které by proti viru mohly být účinné. Není samozřejmě zaručeno, že z těchto analýz vzejde rychle účinný lék, který v dohledné době šíření zastaví. Ale tyto analýzy přispívají k prozkoumání co nejvíce cest, jak proti němu bojovat a mohou pomoci dalšímu výzkumu. Folding@home přímo spolupracuje s mnoha výzkumníky a laboratořemi, takže by výpočetní pomoc měla průběžně pomáhat v jejich snahách.
K hledání potenciálních léčiv proti koronaviru mají přispět následující projekty. Měly by být zahrnuty mezi aktivní projekty i tehdy, pokud klienta nakonfigurujute pro příjem jakékoliv práce (nastavením zapojení na „Any Disease“).
- 11741: Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) receptor binding domain in complex with human receptor ACE2. atoms: 165550, credit: 15396
- 11746: Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) receptor binding domain in complex with human receptor ACE2 (alternative structure to 11741). atoms: 182699, credit: 16615
- 11742: Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) protease in complex with an inhibitor. atoms: 62227, credit: 9405
- 11743: Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) protease – potential drug target. atoms: 62180, credit: 9405
- 11744: Coronavirus SARS-CoV (SARS causing virus) receptor binding domain trapped by a SARS-CoV S230 antibody. atoms: 109578, credit: 7608
- 11745: Coronavirus SARS-CoV (SARS causing virus) receptor binding domain mutated to the SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) trapped by a SARS-CoV S230 antibody. atoms: 110370, credit: 7685
Zapojení do projektu je možné s procesorem Intel, AMD a dokonce i ARM a GPU GeForce i Radeon. Práce, kterou tyto projekty vašemu počítači zadávají, je nicméně určená zejména pro grafické karty (jde o kód Core22 v OpenCL), takže nejvhodnější je právě zapojit paže herních GPU. Klient, tedy aplikace, kterou musíte nainstalovat, existuje pro Windows, Linux i MacOS, začít můžete zde.
Pokud se k těmto projektům připojíte, buďte trpěliví. Údajně teď může chvíli trvat, než vašemu klientu (počítači) bude přidělen kus práce. Jednak je asi mezi lidmi vyšší zájem o tyto projekty, prý ale také do výpočtů jeden velký cloudový provozovat zapojil své servery s instancemi vybavenými GPU, které zřejmě hodně pracovních přídělů pohltily.
https://twitter.com/NVIDIAGeForce/status/1238496311776653312
Hráče vybídla k poskytnutí nečinných GPU (v době, kdy si chcete zkrátit karanténu hraním, je po vás samozřejmě nikdo nechce) mimochodem také Nvidia.
