Naběhnou (např. bootem z USB - můžeš vyzkoušet např. UBCD), ale nefungují správně (nejsou vidět disky, nebo všechny disky). ISA je (pokud vím - už jsem tohle dlouho nezkoumal) z velké části stále emulovaná, včetně starých adres a přerušení.
Problém je (u MS DOS) neschopnost OS zvládat moderní HW přes emulaci (např. více disků než 4), u Win9x zase absence ovladačů (plus stejný problém jako u MSDOS).