Co se AD týká, Samba4 je poměrně robustní řešení, a ačkoli jí chybí ještě docela dost featur (replikace DFS např. - toto ale jde řešit na úrovni samotného Linuxu), tak funkční level na úrovni Win2003 je pro mnoho případů nasazení naprosto postačující. Navíc je to stavebnice, takže se můžeš rozhodnout, jaký použiješ DNS, jaký LDAP server, atd. Se Sambou jsem začínal na verzi 1.9 a za tu dobu ušla neskutečnou cestu.
Nicméně, jak správně píše gogo, já psal o jádru Windows, a to poměrně nebezpečně linuxovatí. Že nad tím poběží Win32API (nebo RT) to je v podstatě fuk, to je otázka co komu vyhovuje, já s Windowsím desktopem problém nemám (ale to nemám v zásadě ani s tím Linuxovým, byť jej primárně nepoužívám).